Séquençage à moyen et haut débit (NGS)
Le séquençage à haut débit (Next-Generation Sequencing, NGS) est une technologie de biologie moléculaire permettant de séquencer rapidement et simultanément un grand nombre de fragments d’ADN ou d’ARN. Cette approche est notamment utilisée pour l’analyse des génomes, des exomes et des transcriptomes.
La plateforme iGenSeq de l’Institut du Cerveau, à Paris, dispose de trois séquenceurs Illumina, permettant de proposer différentes prestations de séquençage adaptées aux besoins des projets de recherche.
Certifiée ISO 9001 depuis 2015 pour ses prestations de séquençage à haut débit, la plateforme iGenSeq s’inscrit dans une démarche d’amélioration continue afin de garantir la qualité et la fiabilité de ses services.
MiSeq i100 (Illumina) |
Séquenceur à moyen débit utilisant une technologie de séquençage à lectures courtes (NGS), capable de générer jusqu’à 30 Gb de données et 100 millions de reads. Il permet des lectures allant jusqu’à 600 cycles.
Séquenceur à haut débit en lectures courtes (600 cycles maximum), pouvant générer de 10 à 540 Gb de données. Idéal pour les petites cohortes ou pour des phases pilotes.
NextSeq 2000 |
Séquenceur à haut débit utilisant une technologie de séquençage à lectures courtes (NGS), capable de générer 10 à 540 Gb de données par analyse, selon la cartouche utilisée.
Il permet des lectures allant jusqu’à 600 cycles et convient particulièrement au séquençage de petites cohortes et à la réalisation d’études pilotes.
NovaSeq X Plus (Illumina) |
Séquenceur à très haut débit utilisant une technologie de séquençage à lectures courtes (NGS), capable de générer 165 Gb à 16 Tb de données par analyse, selon les cartouches et la configuration utilisées.
Équipé de deux flow cells, il permet notamment de séquencer plus de 120 génomes humains complets (WGS) en environ 48 heures, avec une couverture cible de 30×.