regroupant 10 plateformes technologiques de pointe
La plateforme iGenSeq de l’Institut du Cerveau, à Paris, propose des solutions de séquençage de cellules uniques (Single-Cell Sequencing) permettant d’étudier l’expression des gènes et l’épigénome à l’échelle de la cellule individuelle.
Grâce aux technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS), cette approche permet d’explorer la diversité cellulaire avec une grande précision et de mieux comprendre les mécanismes biologiques propres à chaque cellule.
Chromium iX (10x Genomics) |
La plateforme iGenSeq est équipée du système Chromium iX de 10x Genomics, permettant l’analyse transcriptomique et épigénomique à l’échelle unicellulaire.
Cette technologie permet notamment d’étudier l’hétérogénéité cellulaire des tissus, en identifiant les différentes populations cellulaires qui les composent. Elle offre également la possibilité d’explorer les états de différenciation cellulaire et de détecter des populations cellulaires rares.
Applications du Chromium iX
Le système Chromium iX permet différentes approches de séquençage à l’échelle unicellulaire, notamment l’analyse de l’expression génique à partir de cellules entières (scRNA-seq) ou de noyaux isolés (snRNA-seq), ainsi que l’étude de l’accessibilité de la chromatine (scATAC-seq).
Pour l’analyse de l’expression génique en 3’, la technologie repose sur le séquençage de l’extrémité 3’ des transcrits d’ARN, permettant de caractériser leur expression à l’échelle de chaque cellule.
La plateforme iGenSeq prend en charge vos échantillons de cellules en suspension et réalise les différentes étapes expérimentales : partitionnement des cellules, attribution des codes-barres cellulaires (barcoding), préparation des librairies et séquençage.
Les données brutes de séquençage sont ensuite mises à votre disposition pour leur analyse bioinformatique.
Pour connaître les recommandations relatives à la quantité et à la qualité des cellules nécessaires au séquençage, nous vous invitons à consulter notre guide de préparation des échantillons.
